L'Etat Français a privilégié une politique contractuelle en ce qui concerne la gestion des sites Natura 2000.
Actuellement, il existe trois outils contractuels pour la mise en œuvre des actions de gestion des milieux naturels prévues dans le Document d’objectifs (DOCOB) du site :
- les contrats Natura 2000 ni agricoles no forestiers
- les mesures agri-environnementales et climatiques (MAEC), pour les surfaces agricoles uniquement
- la charte Natura 2000